V zbúranej časti Klarisiek bola sakristia
Pri príležitosti milleniárnych osláv (1897) dostal kostol pri kláštore františkánov novú vežu. Projektoval ju profesor Friedrich Schulek ako ideálnu rekonštrukciu pôvodnej veže. Jej realizácia mala taký úspech, že sa začalo uvažovať aj o obnove pôvodného vzhľadu veže klariského kostola.